Edificata insieme al convento nel 1589, questa chiesa era inizialmente intitolata a S. Maria della Pace.

Nel 1828 divenne ospizio, successivamente caserma, poi asilo dei poveri fino al 1922, quando un incendio distrusse la struttura.
Dopo la ricostruzione ex-novo nel 1928, fu riconsacrata e dedicata al Sacro Cuore.