La chiesa inizialmente era attribuita a Santa Maria degli Angioli per volere di San Bernardino da Siena che intorno al 1440 visitò il paese di Agnone.
La chiesa fu completata in seguito da Beato d' Aragona che utlizzò anche le offerte della popolazione.
Il pontefice Nicolo' V dopo la canonizzazione San Bernardino da Siena fece sì che la chiesa prendesse il nome del beato e perdesse quello orginale dato dal santo stesso.
Nel convento vi alloggiarono per un periodo osservanti e riformisti dopodiche fu chiuso perchè divento' dimora dei monaci.
Oggi giorno l'edificio ha perso la sua originale funzione ed è stato trasformato in un centro per anziani.